黄瓜绿斑驳花叶病毒、番茄环斑病毒及南方菜豆花叶病毒的分子检测

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沈阳农业大学硕士学位论文摘要以辽宁盖州地区表现黄瓜绿斑驳花叶病毒(CGMMV-LN)症状的西瓜叶片为材料,以总RNA为模板,通过RT-PCR扩增获得了CGMMV-LN的四段部分重叠并覆盖全长的片段。序列分析结果表明:CGMMV-LN全长基因由6422个碱基组成,印基副由486个碱基组成,编码161个氨基酸,与已报道的其他11个CGMMV分离物相同。核苷酸序列同源性在90%以上,氨基酸序列同源性高于98%。CGMMV-LN的3,NTR由176个碱基组成,与CGMMV-KW、CGMMV-SH和CGMMV-KOM的碱基数目相同,但比CGMMV-W多1个碱基。与其他3种Tobamovirus属病毒3’NTR末端的17个碱基则完全一致.3 7NTR序列的高度保守性有助于基因组末端RT-PCR引物的设计。以引自加拿大的ToRSV悬钩子分离物(ToRSV-Ra)接种番奋发病后为试材,以总RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增病毒复制酶基因(Rd.Rp)的eDNA片断并将其克隆到pMDl8-T载体上。序列测定结果表明:Rasp-2 RdRp基因由2133个核苷酸组成,编码71 L个氨基酸;Rasp.2半胱氨酸蛋白酶和RdRp之间的蛋白酶切割位点为Q/v。Rasp一2与其他分离物及株系RdRp的核苷酸序列同源性为79%.84%,氨基酸序列同源性为89*/*-94%。聚类分析结果显示,葡萄黄脉株系(GYV)与其他分离物及株系关系最远,Rasp-2与其他分离物及株系亲... 内容来自淘豆网转载请标明出处.